Podría ser, pero que se apague el coche por eso es raro.
Lo que tienes que buscar es la entrada de agua. Po donde entra ese agua a la caja del filtro eso no es normal.
Aunque no tuviera el cubrecarter no debería entrar un gota.
Si no tuviera pase de rueda pues posiblemente le entrase pero ni así, porque los b6 b7 la toma de aire en la caja es por arriba.