Lamento mucho lo ocurrido. Todas las marcas tienen su fallos y quizás si te vas a otra no tienes fallo de la caja pero si del motor, eso nunca se sabe.
Es cierto el problema que han tenido esas cajas (como las famosas multitronic de b6 y b7). El problema que este tipo de averías suelen ser costosas y bueno, si vas al concesionario ni te cuento, porque trabajan con piezas de origen.
Esta avería como dicen los compis te la puede solucionar talleres específicos en cajas de cambios, tu se la envías y ellos te la mandan de vuelta reparada, por menos de la mitad de lo que te piden.
Generalizar sobre cualquier marca no es bueno, y hablando de esta; "he tenido" 14 A4 todas las generaciones hasta el facelift y puedo decir que es un gran coche con sus mas y sus menos pero todos se han ido con mas de 400.000kms sin averías significativas.
actualmente el facelift tiene 509.000kms con cambio multitornic y toquemos madera pero hasta el día de hoy no se le cambio nada. (bueno miento, los amortiguadores traseros hace 2 semanas, por que eran los de origen y me quedan los delanteros)
consejo; saca el coche del conce porque te van a soplar un dineral, llévalo a un taller de toda la vida, que te desmonten la caja y se la mandas a un taller especializado, podrás seguir disfrutando el coche muchos años mas.
Un saludo y mucha suerte.