Hola para saber si el alternador carga, con el coche encendido comprueba con el multimetro la carga de la bateria si esta bien, debería de dar entre 13v ~ 14v.
Pero me parece que tu fallo es de otra cosa y seguramente sea de algun consumo de algún componente del coche, con el multimetro con el coche apagado ve comprobando el amperaje que hay en cada fusible, de ahí sacaras los consumos.