Buenas.
Tranquilo....
Primero tienes que darnos mas datos... ¿Ha sido al tocar con el VagCom o solo has quitado la batería?.
Si es lo segundo, ponte en marcha y en unos pocos metros se te quitará el error.
Si fuera porque lo has desconfigurado con VagCom, puedes volver atrás mirando en la carpeta "LOGS" y "DEBUG", en la ruta C:\Ross-Tech\VCDS.
Ahí pone lo que has tocado, con la antigua y nueva codificación.
Recuerda que lo primero es hacer un "Auto-Scan" y guardarlo antes de tocar nada, para tener las configuraciones originales a salvo.
Suerte