Los 3.0 tdi de esa época suelen dar fallos de inyectores si o si, si no los ha dado seguramente los dará.
Si el 2.0 tdi es de los últimos tendrá un motor fiable y con los fallos corregidos.
Sobre el gasto, si el 3.0 es quattro en ciudad es mas torpon y consume mas por temas lógicos, mayor peso, mas cilindros... pero en carretera tiene un buen consumo y un empuje que el 2.0 tdi no lo tiene ni por asomo.
El tema s-line, pues es una pasta montarlo y si tiene s-line interior el 2.0 me haria decantarme hacia ese acabado ya que es difícil encontrar, ademas en ciudad tendrás buenos consumos con el.
Un saludo.