A lo del aceite que esta negro, tengo entendido que es normal, despues de rodar casi 30.000 km el aceite esta mas negro que el carbon, aunque lo cambies, no sale todo, y al echar el nuevo, se mezcla con lo que quede del otro y por eso que lo veas negro. Para tenerlo mas limpio tendrias ahora que rodar con el nuevo unos 3.000 o 5.000 km y volver a cambiarlo y aun asi no lo tendras limpio del todo.
A lo del precio del aceite, es normal lo que te han cobrado, en Audi la garrafa de aceite Castro 5/30 cuesta unos 90€. Yo creo que habras mirado mal la factura y no son 45 litros, si no 4,5L y no 2,28€ el litro si no 22,8€ (las cuentas salen).
El filtro del gasoil te lo cambiaran en la siguiente de los 60.000km, puedes ir a recambios y comprarlo y en cualquier taller te lo cambian por si tu no te atreves, lo digo por si no te quieres esperar tanto a cambiarlo.
Saludos.